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4D-丙二酰化修饰蛋白质组学

4D-丙二酰化修饰蛋白质组学

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蛋白质丙二酰化(malonylation)是一种蛋白的翻译后修饰,主要发生在赖氨酸残基。将丙二酰基团从丙二酰辅酶A转移到赖氨酸残基上的一种化学修饰,此过程是可逆的。赖氨酸本身是带有正电荷的,丙二酰化发生后,将正电荷改变成负电荷,这种对蛋白带电性的改变会影响蛋白构象和蛋白间相互作用。越来越多的研究表明赖氨酸丙二酰化能调控肝脏组织中葡萄糖和脂肪酸的代谢,并与二型糖尿病和肥胖症等高发病率的代谢疾病相关。因此,对赖氨酸丙二酰化位点的精准识别有助于人们深入了解相关疾病的发病机理以及治疗方法。 4D-label free丙二酰化修饰蛋白组学是基于新一代timsTOF Pro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行丙二酰化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。








实验流程:
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应用方向:

 代谢调控:代谢疾病、代谢紊乱等;


 药理药靶、基因敲除/过表达的修饰表达分析;


 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究;


 细胞自噬、细胞周期、衰老等信号通路;


 神经及退行性疾病、肿瘤发病机制等机制研究;


 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选。










技术优势:

 4D技术加持,提高定量的准确性、鉴定深度,更加适合微量样本;


 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便;


 前沿技术——基于新一代质谱平台(Bruker timsTOF pro),检测速度提升近一倍;


 经验丰富——超16年蛋白平台服务经验,拥有数量与质量领先的高水平项目文章;


 数据保证——采用进口金标抗体,高标准修饰富集操作,数据结果稳定可靠;


 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析,实现快捷”一站式”服务。










据分析:



标准数据分析内容

蛋白质总鉴定数量分析

蛋白鉴定与定量结果统计、韦恩图分析、差异结果数量统计、火山图、聚类热图

差异蛋白质功能分析

亚细胞定位、结构域分析、motif分析、GO功能分析、KEGG通路分析、互作网络分析

质量控制分析

肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布

高级数据分析内容

WGCNA共表达分析

获得与表型强关联的核心蛋白质

趋势聚类分析

探讨蛋白质的表达趋势模式


具体沟通:400-9688-170



增值服务

组织/切片服务

各类病理染色服务

免疫组织化学(IHC)实验服务

western blot(wb)实验服务

动物各类疾病模型服务

动物活体成像实验服务

动物微型CT成像实验服务

动物核磁共振(MRI)成像实验服务

动物超声成像实验服务

分子及蛋白实验检测服务

透射电镜(TEM)实验服务

细胞培养实验服务

细胞造模实验服务

细胞毒性检测服务

慢病毒、腺病毒、载体构建


南京中科世康生物拥有专业的动物造模平台,实验人员拥有十年的实战经验,跟多个高校、医院老师合作,服务内容包含:透射电镜、动物造模细胞实验HE染色免疫组化代谢组学Western BlotPCR实验、膜片钳、外显子测序等等,期待您的咨询~ 400热线-9688170


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